Структура института >> Научные подразделения >> Сектор № 6
СЕКТОР № 6
Функциональная и сравнительная геномика прокариот
Заведующий сектором - к.б.н. Родионов Дмитрий Александрович
Сектор " Функциональной и сравнительной геномики прокариот" создан с целью проведения исследований в области сравнительной и функциональной геномики прокариотических микроорганизмов.
Основным направлением работы сектора является анализ геномных последовательностей бактерий для реконструкции путей центрального метаболизма и изучения регуляторных транскрипционных сетей у различных микроорганизмов.
В ходе проведения исследований по сравнительному компьютерному анализу регуляции транскрипции в геномах бактерий за последние 10 лет были получены обширные научные результаты, изучены регулятороные системы для нескольких десятков новых транскрипционных факторов и РНК переключателей. Впервые найдены и описаны регулоны контролирующие экспрессию генов из центральных метаболических путей биосинтеза и катаболизма, гомеостаза металлов и ответа на клеточные стрессы. Метаболическая реконструкция многих из этих метаболических путей позволила впервые найти и приписать функцию множеству новых ферментов, транспортеров и регуляторов, были проведено широкомасштабное сравнение систем регуляции некоторых метаболических путей в различных таксономических группах бактерий.
В сотрудничестве с Новичковым П.С. из Национальной Лаборатории Лоуренса Беркли была создана новая база данных RegPrecise позволяющая систематизировать бактериальные регулоны, изученные методами сравнительной геномики, и показывать их структуру и консервативность в группах геномов с использованием концепции регулога. Детальное описание многих изученных регуляторных систем загружено и представлено в базе данных RegPrecise доступной на сайте http://regprecise.lbl.gov.
СОТРУДНИКИ СЕКТОРА:
1. АРЗАМАСОВ Александр Алексеевич - и.о. младшего научного сотрудника 2. АШНИЕВ Герман Альфредович - стажер-исследователь 3. ЛЕЙН Семен Александрович - к.б.н., и.о. научного сотрудника 4. НОГИНА Дарья Сергеевна стажер-исследователь 5. ПЕТРОВ Сергей Николаевич - и.о. младшего научного сотрудника 6. РОДИОНОВ Владимир Александрович - к.с.н. и.о. научного сотрудника 7. РОДИОНОВ Дмитрий Александрович - к.б.н. ,заведующий сектором 8. ХОРОШКИН Матвей Сергеевич - к.б.н., и.о. младшего научного сотрудника 9. ФРОЛОВА Мария Сергеевна - и.о. младшего научного сотрудника 10. ЯБЛОКОВ Станислав Николаевич - и.о. младшего научного сотрудника
|