17 марта (вторник), 1300, зал заседаний УС ИППИ РАН
GPS и reAdmix - алгоритмы для отслеживания происхождения генотипов
В антропологии, эволюционной теории и медицине очень важную роль играет понимание генетической структуры населения, а она может быть очень сложной. Дело в том, что по мере роста мобильности населения все больше семей образуют представители разных этнических групп, так что определение генного состава для нужд персональной медицины и фармакологии (фармакокинетики) зачастую является сложной задачей. С появлением все большего числа смешанных генотипов растет необходимость в инструментах предсказания генетической структуры сразу по многим генетическим линиям. Наша лаборатория старается эту задачу решить. Неправильная или неточная система классификации смешанных генотипов может привести к дорогостоящим ошибкам в интерпретации экспрессии генов, - в первую очередь это касается предрасположенности к заболеваниям и воздействия новых лекарств. Мы предлагаем новый, более совершенный инструмент отслеживания географического происхождения генотипа, который хорошо работает для сильно перемешанных генов. Алгоритм reAdmix может учитывать также уже имеющуюся информацию о происхождении генотипа (например, сведения о шотландской или турецкой бабушке). Наш алгоритм доступен онлайн по ссылке.
| 14.03.2015 | |