Основные публикации В.В. Вьюгина по тематике Лаборатории 6 c 2000 года

Вернуться

  1. Вьюгин В.В., Горбунов К.Ю., Любецкий В.А. Алгоритмы выделения регуляторного сигнала и построения эволюционных деревьев. Труды 2-ой международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», Самара, Издательство РАН, 2000, с. 130-137.
  2. Вьюгин В.В., Любецкий В.А. Об одном алгоритме поиска горизонтального переноса генов на основе филогенетических деревьев белков. Информационные процессы, том 1, No 2, 2001, с. 167-177.
  3. Вьюгин В.В. О неустойчивости индивидуальной эргодической теоремы. Проблемы передачи информации, том 37, вып. 2, 2001, с. 27-39.
  4. V'yugin V.V. Most sequences are stochastic. Information and computation, vol. 169, 2001, p. 252-263.
  5. V'yugin V.V. Non-robustness property of the individual ergodic theorem. Problems of information transmission, v.37, No 2, 2001, p. 23-33.
  6. Вьюгин В.В., Любецкий В.А. О некоторых способах отбора горизонтально перенесенных генов на основе филогенетических данных. Информационные процессы, 2002, том 2, No 1, с. 120-140.
  7. Lyubetsky V.A., V’yugin V.V. Method of horizontal gene transfer determination using phylogenetic data. Proceedings of the third international conference of bioinformatics of genome regulation and structure, BGRS’2002, Novosibirsk, Russia, July 14-20, 2002, v. 2, p. 60-62.
  8. Вьюгин В.В., Гельфанд М.С., Любецкий В.А. Согласование деревьев: реконструкция эволюции видов по филогенетическим деревьям генов. Молекулярная биология, 2002, т. 36, № 5, с. 807-816.
  9. Vyugin M.V., V'yugin V.V. Predictive complexity and information. Proceedings Fifteen International Conference on Computational Learning Theory -- COLT'02, Lecture Notes on Artificial Intelligence. 2002. v. 2375, p. 90-104.
  10. V'yugin V.V. Does snooping help? Theoretical Computer Science. 2002, v. 276, p. 407-415.
  11. V'yugin V.V. Suboptimal measures of predictive complexity for absolute loss function. Information and Computation. 2002, v. 175, p. 146-157.
  12. Vyugin M.V., V'yugin V.V. On complexity of easy predictable sequences. Information and Computation. 2002, v. 178, p. 241-252.
  13. Lyubetsky V.A., V’yugin V.V. Methods of horizontal gene transfer determination using phylogenetic data (2). In Silico Biology (An International Journal on Computational Molecular Biology), V. 3, No 1,2, 2003, p. 17-31 (the computer version http://www.bioinfo.de/isb/2003/03/0003).
  14. Вьюгин В.В., Гельфанд М.С., Любецкий В.А. Идентификация горизонтально перенесенных генов на основе филогенетических данных. Молекулярная биология, том 37, № 4, 2003, c. 673-687.
  15. Lyubetsky V.A., V’uygin V.V. Complex phylogenetic analysis of evolutionary history for prokaryotes families. MCCMB’03, 2003, p. 146-147.
  16. Вьюгин В.В. Вариационные задачи для аддитивных функций потерь и колмогоровской сложности. Доклады академии наук. 2003. Т. 390. № 5. С. 595-598.
  17. Вьюгин В.В. Проблемы устойчивости универсальных схем сжатия информации. Проблемы передачи информации. 2003. Т. 39. № 1. С. 36-52.
  18. Вьюгин В.В., Маслов В.П. Об экстремальных соотношениях для колмогоровской сложности и аддитивных функций потерь. Проблемы передачи информации. 2003. Т. 39. № 4. С. 71-87.
  19. Nuretdinov I., V'yugin V.V., Gammerman A. Transductive Confidence Machine is Universal. Lecture Notes in Computer Science, Algorithmic Learning Theory, 2842, Springer, Heidelberg, 2003. P. 283-297.
  20. Lyubetsky V.A., V’yugin V.V. Measuring the dissimilarity between gene and species trees, the quality of a COG. Proceedings of the fourth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure, volume 2, BGRS’2004, Novosibirsk, July 25-30, 2004, p. 281-284.
  21. Lyubetsky V.A., Vyugin V.V. Complex phylogenetic analysis of the evolutionary history for some prokaryotes family. Biophysics (Moscow), vol. 48, Suppl. 1 (2003), 2004, p. 97–106.
  22. Lyubetsky V.A., Gorbunov K.Yu., V’yugin V.V. Inferring evolutionary events, quality of COGs, measuring the dissimilarity between gene and species trees. Presentation abstracts of the EMBO World Phylogenetic Course 2004. November 1-7, 2004, Rio de Janeiro, Brazil (устное сообщение).
  23. V. Lyubetsky, K. Gorbunov, L. Rusin, V. V'yugin, Algorithms to reconstruct evolutionary events at molecular level and infer species phylogeny. An article in the book: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. (Eds. N. Kolchanov and R. Hofestaedt) Springer Science & Business Media, Inc. 2005, p. 189-204.
  24. Любецкий В.А., Горбунов К.Ю., Вьюгин В.В., Русин Л.Ю. Удаление шума в множественном выравнивании аминокислотных последовательностей, Информационные процессы, 2005, 5, №5 с. 380-391.
  25. L.Yu. Rusin, V.V. V'yugin, V.A. Lyubetsky. Enhancing phylogenetic inference: concentration of the signal in sequence data, МССМВ05, 2005, p. 342-346.
  26. V.A. Lyubetsky, V.V. V'yugin A model for evolutionary event reconstruction, МССМВ05, 2005, p. 217-219.

Вернуться