Основные публикации В.А. Любецкого по тематике Лаборатории 6 c 1999 года

Вернуться

  1. В.А. Любецкий. Логика устной речи в сравнении с логикой письменной речи. Труды второго философского конгресса, Екатеринбург, часть 1, 1999, с. 222.
  2. В.А. Любецкий. О преобразовании классических выводов в интуиционистские. Труды второй международной конференции «Смирновские чтения», Москва, 1999, с. 38-41.
  3. В.А. Любецкий. Об основах интеллектуальных процессов. Труды второго философского конгресса, Екатеринбург, часть 1, 1999, с. 223-224.
  4. В.А. Любецкий. Логические модели процессов информационного взаимодействия. Труды 1-ой международной конференции РАН «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», Самара, 1999, с. 133-145.
  5. Кузнецов Н.А., Любецкий В.А. Компьютерная логика в информационных процессах. Проблемы передачи информации, РАН, том 35, вып. 2, 1999, с. 107-111.
  6. V.A. Lyubetsky, M.J.A. Larijani. Topics in Classical and Intuitionistic Model Theory. Gardariki, Moscow, 2000, 390 pages.
  7. Кузнецов Н.А., Любецкий В.А., Чернавский А.В. К вопросу о понятии информационного взаимодействия, 1: допсихическая биоинформатика. Труды 2-ой международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», Самара, Издательство РАН, 2000, с. 8-20.
  8. Вьюгин В.В., Горбунов К.Ю., Любецкий В.А. Алгоритмы выделения регуляторного сигнала и построения эволюционных деревьев. Труды 2-ой международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», Самара, Издательство РАН, 2000, с. 130-137.
  9. Горбунов К.Ю., Любецкий В.А. Об алгоритме выявления регуляторного сигнала в наборе последовательностей. Логические исследования. выпуск 7, Москва, Наука, 2000, с. 159-163.
  10. Верещагин Н.К., Любецкий В.А. Алгоритм определения вторичной структуры РНК. Труды научно-исследовательского семинара логического центра ИФ РАН, выпуск 14, Москва, Издательство РАН, 2000, с. 99-109.
  11. А.В. Зарелуа, В.А. Любецкий. Предисловие редакторов к первому тому книги А. Маллиос «Геометрия векторных пучков», Мир, 2000 (460 страниц в книге).
  12. А.В. Зарелуа, В.А. Любецкий. Предисловие редакторов ко второму тому книги А. Маллиос «Геометрия векторных пучков», Мир, 2001 (442 страницы в книге).
  13. Данилова Л.В., Горбунов К.Ю., Гельфанд М.С., Любецкий В.А. Алгоритм выделения регуляторных сигналов в последовательностях ДНК (1). Информационные процессы, том 1, No 1, 2001, с. 56-63.
  14. Гельфанд М.С., Вьюгин В.В., Любецкий В.А. Об одном способе построения деревьев эволюции видов по множественным генетическим данным. Информационные процессы, том 1, No 1, 2001, с. 64-77.
  15. Данилова Л.В., Горбунов К.Ю., Гельфанд М.С., Любецкий В.А. Алгоритм выделения регуляторных сигналов в последовательностях ДНК (2). Молекулярная биология, том 35, № 6, 2001, с. 987-995.
  16. Вьюгин В.В., Любецкий В.А. Об одном алгоритме поиска горизонтального переноса генов на основе филогенетических деревьев белков. Информационные процессы, том 1, No 2, 2001, с. 167-177.
  17. Горбунов К.Ю., Любецкая Е.В., Любецкий В.А. О двух алгоритмах поиска альтернативной вторичной структуры РНК. Информационные процессы, том 1, No 2, 2001, стр. 178-187.
  18. Любецкий В.А., Селиверстов А.В. Об одном вероятностном алгоритме решения NP-полной проблемы, Труды третьей международной конференции «Смирновские чтения», РАН, Москва, 2001, с. 47-49.
  19. Данилова Л.В., Любецкий В.А. Алгоритм выделения регуляторных сигналов: тестирование и биологические применения. Труды 3-ей международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», Самара, РАН, 2001, с. 632-634.
  20. Кузнецов Н.А., Любецкий В.А., Чернавский А.В. К вопросу о понятии информационного взаимодействия, 2: доречевой интеллект. Труды 3-ей международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», Самара, РАН, 2001, с. 25-42.
  21. Lyubetsky V.A. First projective sets, AE-prefix and quantifiers elimination. Abstracts of International conference Mathematical Logic, Algebra and Set theory dedicated to the 100-th anniversary of P.S. Novikov, August 27-31 2001, Steklov Mathematical Institute RAS, Moscow, 2001, p. 27.
  22. Горбунов К.Ю., Любецкий В.А. Алгоритм поиска консервативных вторичных структур в наборе фрагментов РНК. Информационные процессы, 2002, том 2, No 1, с. 55-58.
  23. Леонтьев Л.А., Любецкая Е.В., Любецкий В.А. Модифицированный алгоритм поиска альтернативных вторичных структур РНК и результаты счета. Информационные процессы, 2002, том 2, No 1, с. 100-105.
  24. Вьюгин В.В., Любецкий В.А. О некоторых способах отбора горизонтально перенесенных генов на основе филогенетических данных. Информационные процессы, 2002, том 2, No 1, с. 120-140.
  25. Кузнецов Н.А., Любецкий В.А., Чернавский А.В. К вопросу о понятии информационного взаимодействия, 3: речевой интеллект. Труды 4-ой Международной конференции, 17-23 июня 2002, Самара, с. 7-17.
  26. Lyubetsky V.A., V’yugin V.V. Method of horizontal gene transfer determination using phylogenetic data. Proceedings of the third international conference of bioinformatics of genome regulation and structure, BGRS’2002, Novosibirsk, Russia, July 14-20, 2002, v. 2, p. 60-62.
  27. Lyubetsky E.V., Lyubetsky V.A. Algorithm for searching alternative secondary RNA structures. Proceedings of the third international conference of bioinformatics of genome regulation and structure, BGRS’2002, Novosibirsk, Russia, July 14-20, 2002, v. 3, p. 15-17.
  28. Gorbunov K.Yu., Lyubetsky V.A. An algorithm for searching common secondary structures in a set of RNA sequences. Proceedings of the third international conference of bioinformatics of genome regulation and structure, BGRS’2002, Novosibirsk, Russia, July 14-20, 2002, v. 3, p. 25-23.
  29. Lyubetsky V.A., Rubanov L.I. Parallel algorithm for searching regulatory signal in bacterial genome. Proceedings of the third international conference of bioinformatics of genome regulation and structure, BGRS’2002, Novosibirsk, Russia, July 14-20, 2002, v. 1, p. 23-25.
  30. Вьюгин В.В., Гельфанд М.С., Любецкий В.А. Согласование деревьев: реконструкция эволюции видов по филогенетическим деревьям генов. Молекулярная биология, 2002, т. 36, № 5, с. 807-816.
  31. Любецкий В.А., Селиверстов А.В. Некоторые алгоритмы, связанные с конечными группами. Информационные процессы, том 3, No 1, 2003, с. 39-46.
  32. Голубцов П.В., Любецкий В.А. Стохастические динамические игры с информацией различного типа. Проблемы передачи информации, 2003, том 39, вып. 3, с. 40-71.
  33. Lyubetsky V.A., V’yugin V.V. Methods of horizontal gene transfer determination using phylogenetic data (2). In Silico Biology (An International Journal on Computational Molecular Biology), V. 3, No 1,2, 2003, p. 17-31 (the computer version http://www.bioinfo.de/isb/2003/03/0003).
  34. L.V. Danilova, V.A. Lyubetsky, M.S. Gelfand. An algorithm for identification of regulatory signals in unaligned DNA sequences, its testing and parallel implementation. In Silico Biology, V. 3, No 1,2, 2003, p. 33-47 (the computer version: http://www.bioinfo.de/isb/2003/03/0004).
  35. Вьюгин В.В., Гельфанд М.С., Любецкий В.А. Идентификация горизонтально перенесенных генов на основе филогенетических данных. Молекулярная биология, том 37, № 4, 2003, c. 673-687.
  36. Любецкая Е.В., Леонтьев Л.А., Гельфанд М.С., Любецкий В.А. Поиск альтернативных вторичных структур РНК, регулирующих экспрессию бактериальных генов. Молекулярная биология, том 37, № 5, 2003, c. 834-842.
  37. Danilova L.V., Gelfand M.S., Lyubetsky V.A., Laikova O.N. Computer analysis of glycerol-3-phosphate metabolism regulation in proteobacterial genomes. Mol. Biol., №5, 2003, с. 843-849.
  38. Любецкая Е.В., Леонтьев Л.А., Любецкий В.А. Поиск альтернативных вторичных структур в классе гамма-протеобактерий. Информационные процессы, том 3, No 1, 2003, с. 23-38.
  39. Любецкий В.А., Горбунов К.Ю. Поиск консервативных вторичных структур РНК. Информационные процессы, том 3, No 1, 2003, с. 47-60.
  40. Кузнецов Н.А., Любецкий В.А., Чернавский А.В. О понятии информационного взаимодействия, 1: допсихический уровень. Информационные процессы, том 3, No 1, 2003, с. 1-22.
  41. Горбунов К.Ю., Миронов А.А., Любецкий В.А. Поиск консервативной вторичной структуры РНК. Молекулярная биология, том 37, № 5, 2003, с. 850-860.
  42. Голубцов П.В., Любецкий В.А. Результат информационного процесса зависит от характера и объёма доступной его участникам информации. Международная конференция, РАН, Самара, 2003, с. 445-453.
  43. Кановей В.Г., Любецкий В.А. Классические проблемы дескриптивной теории множеств, Труды 4-й международной Смирновской конференции, РАН, Москва, 2003, с. 32-34.
  44. V.G. Kanovei, V.A. Lyubetsky. On the existence of regular non-definable sets of reals. Труды конференции «Колмогоров и современная математика (100 лет Колмогорову)», Москва, 2003, p. 690.
  45. Гельфанд М.С., Любецкий В.А. ДНК: от молекулы до генома, от биохимических озарений к алгоритмическому анализу. Вестник РАН, № 11, 2003, с. 963-970.
  46. Danilova L.V., Lyubetsky V.A., Laikova O.N. Computer detecting of glycerol-3-phosphate metabolism regulation in proteobacterial genomes. MCCMB’03, 2003, p. 52-53.
  47. Gorbunov K.Yu., Lyubetsky V.A. Detecting common secondary structures in a set of RNA sequences and its testing. MCCMB’03, 2003, p. 83-85.
  48. Lyubetsky V.A., V’uygin V.V. Complex phylogenetic analysis of evolutionary history for prokaryotes families. MCCMB’03, 2003, p. 146-147.
  49. Lyubetskaya E.V., Leontiev L.A., Lyubetsky V.A. Algorithm for detecting alternative secondary RNA structures and mass analysis attenuator regulation in proteobacteria. MCCMB’03, 2003, p. 144-145.
  50. Кановей В.Г., Любецкий В.А. О некоторых классических проблемах дескриптивной теории множеств. Успехи математических наук, т. 55, № 5, 2003, с. 3-88.
  51. Кузнецов Н.А., Любецкий В.А., Чернавский А.В. О понятии информационного взаимодействия, 2: допсихический уровень. Информационные процессы, том 3, No 2, 2003, с. 1-22.
  52. Голубцов П.В., Любецкий В.А. Информационная структура динамических игр и объем доступной игрокам информации. Логические исследования, РАН, 2003, с. 36-47.
  53. Кузнецов Н.А., Любецкий В.А., Чернавский А.В. О понятии информационного взаимодействия, 3: речевой интеллект. Информационные процессы, том 4, No 2, 2004, с. 127-132.
  54. Vitreschak A.G., Lyubetskaya E.V., Shirshin M.A., Gelfand M.S., Lyubetsky V.A. Attenuation regulation of amino acid biosynthetic operons in proteobacteria: comparative genomics analysis. FEMS Microbiol Lett. 2004 May 15; 234(2), p. 357-370.
  55. Leontiev L.A., Shirsin M.A., Lyubetsky V.A. Detection of classical attenuation in bacterial genomes. Proceedings of the fourth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure, volume 1, BGRS’2004, Novosibirsk, July 25-30, 2004, p. 116-118.
  56. Lyubetsky V.A., Seliverstov A.V. Amino acid biosynthesis attenuation in bacteria. Proceedings of the fourth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure, volume 1, BGRS’2004, Novosibirsk, July 25-30, 2004, p. 307-310.
  57. Gorbunov K.Yu., Lyubetsky V.A. A model of tryptophan biosynthesis regulation. Proceedings of the fourth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure, volume 2, BGRS’2004, Novosibirsk, July 25-30, 2004, p. 53-55.
  58. Lyubetsky V.A., V’yugin V.V. Measuring the dissimilarity between gene and species trees, the quality of a COG. Proceedings of the fourth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure, volume 2, BGRS’2004, Novosibirsk, July 25-30, 2004, p. 281-284.
  59. К.Ю. Горбунов, В.А. Любецкий. Модель регуляции биосинтеза. Труды 6 международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», 14-17 июня 2004, РАН, с. 151-153
  60. В.А. Любецкий, А.В. Селиверстов. Геометрический метод поиска клики в графе и его применение для выделения сигнала. Труды 6 международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», 14-17 июня 2004, РАН, с. 154-157.
  61. Е.В. Любецкая, Л.А. Леонтьев, М.А. Ширшин, В.А. Любецкий. Алгоритм поиска сигнала со сложной структурой. Труды 6 международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», 14-17 июня 2004, РАН, с. 158-162.
  62. Н.А. Кузнецов, М.С. Гельфанд, В.А. Любецкий. Биоинформатика бактерий – основные задачи и характер моделей. Труды 6 международной конференции «Проблемы управления и моделирования в сложных системах», 14-17 июня 2004, РАН, с. 5-11.
  63. В.А. Любецкий. Основные понятия элементарной математики. Рекомендовано в качестве учебного пособия для университетов и пединститутов Айрис-пресс, 625 страниц.
  64. В.А. Любецкий, А.В. Селиверстов. Многодольные графы с двумя вершинами в каждой доле. Информационные процессы, 2004, том 4, No 2, стр. 127-132.
  65. Кановей В.Г., Любецкий В.А. О множестве всех конструктивных по Геделю вещественных чисел. Труды Математического института РАН им. Стеклова, том 247, 2004 (декабрь), с. 95-128.
  66. V.A. Lyubetsky, A.V. Seliverstov. Note on Cliques and Alignments. Информационные процессы, 2004, том 4, No 3, с. 241-246.
  67. А.В. Селиверстов, В.А. Любецкий. Особенности синтеза цистеина у Corynebacterium, Mycobacterium и Propionibacterium. Информационные процессы, 2004, том 4, No 3, с. 247-250.
  68. Кановей В.Г., Любецкий В.А. О совершенных подмножествах инвариантных СА-множеств. Математические заметки РАН, 2005, 77, 3, с. 334-338.
  69. Gorbunov K.Yu., Lyubetsky V.A. New approach for detecting common secondary structures in a set of RNA sequences. Biophysics (Moscow), vol. 48, Suppl. 1 (2003), 2004, p. 56-67.
  70. Lyubetsky V.A., Vyugin V.V. Complex phylogenetic analysis of the evolutionary history for some prokaryotes family. Biophysics (Moscow), vol. 48, Suppl. 1 (2003), 2004, p. 97–106.
  71. Lyubetsky V.A., Gorbunov K.Yu., V’yugin V.V. Inferring evolutionary events, quality of COGs, measuring the dissimilarity between gene and species trees. Presentation abstracts of the EMBO World Phylogenetic Course 2004. November 1-7, 2004, Rio de Janeiro, Brazil (устное сообщение).
  72. V. Kanovei, V. Lyubetsky. A cofinal family of equivalence relations generated by Borel ideals, Conference of Association for Symbolic Logic, Greece, Logic Colloquium 2005, ASL European Summer Meeting, July 28 - August 2, Athens, Greece, University of Athens, Greece, p. 83.
  73. Горбунов К.Ю., Любецкий В.А. Поиск предковых генов, нарушающих согласованность деревьев белков и видов. Молекулярная биология, 2005, 39, № 5, с. 847-858.
  74. V. Lyubetsky, K. Gorbunov, L. Rusin, V. V'yugin, Algorithms to reconstruct evolutionary events at molecular level and infer species phylogeny. An article in the book: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. (Eds. N. Kolchanov and R. Hofestaedt) Springer Science & Business Media, Inc. 2005, p. 189-204.
  75. A.V. Seliverstov, H. Putzer, M.S. Gelfand, V.A. Lyubetsky, Comparative analysis of RNA regulatory elements of amino acid metabolism genes in Actinobacteria. BMC Microbiology 2005, 5:54 (http://www.biomedcentral.com/1471-2180/5/54).
  76. Любецкий В.А., Селиверстов А.В. Регуляция экспрессии генов биосинтеза аминокислот и аминоацил-тРНК синтетаз у Актинобактерий. Молекулярная биология, 2005, 39, № 6, c. 1072-1075.
  77. Л.А. Леонтьев, В.А. Любецкий, А.В. Селиверстов, Алгоритм массового поиска опосредованной Т-боксом транскрипционной регуляции у бактерий. Молекулярная биология, 2005, 39, № 6, c. 1076-1078.
  78. Любецкий В.А., Горбунов К.Ю., Пирогов С.А., Рубанов Л.И., Селиверстов А.В. Алгоритм и результаты тестирования для модели регуляции экспрессии генов у бактерий на основе формирования вторичных структур РНК, Информационные процессы, 2005, 5, № 5, с. 337-366.
  79. Любецкий В.А., Горбунов К.Ю., Вьюгин В.В., Русин Л.Ю. Удаление шума в множественном выравнивании аминокислотных последовательностей, Информационные процессы, 2005, 5, №5 с. 380-391.
  80. В.А. Любецкий, А.В. Селиверстов, Поиск консервативных участков в лидерных областях генов в случае известного дерева видов, Информационные процессы, 2005, 5, № 4, с. 265-270.
  81. А.В. Селиверстов, В.А. Любецкий, Регуляция трансляции в хлоропластах, Информационные процессы, 2005, 5, № 5, с. 400-404.
  82. V.A. Lyubetsky, S.A. Pirogov. A model for bacterial gene expression regulation with secondary RNA structures, МССМВ05, 2005, p. 214-216.
  83. A.V. Seliverstov, V.A. Lyubetsky. RNA regulatory structures in Actinobacteria and Cyanobacteri, МССМВ05, 2005, p. 351-353.
  84. K.Yu. Gorbunov, V.A. Lyubetsky. Algorithms to reconstruct ancestral gene evolution events, МССМВ05, 2005, p. 128-129.
  85. L.Yu. Rusin, V.V. V'yugin, V.A. Lyubetsky. Enhancing phylogenetic inference: concentration of the signal in sequence data, МССМВ05, 2005, p. 342-346.
  86. V.A. Lyubetsky, V.V. V'yugin A model for evolutionary event reconstruction, МССМВ05, 2005, p. 217-219.
  87. L.A. Leontiev, A.V. Seliverstov, V.A. Lyubetsky. An algorithm for mass searching of T-box structures in bacteria, МССМВ05, 2005, p. 202-206.
  88. Любецкий В.А., Пирогов С.А. Модель аттенюаторной регуляции у бактерий, Труды конференции РАН "Проблемы управления и моделирования в сложных системах, VII Международная конференция", 2005, Самара, с. 205-209.
  89. Пирогов С.А., Горбунов К.Ю., Любецкий В.А. Макро- и микросостояния в модели аттенюаторной регуляции экспрессии генов у бактерий, Труды конференции РАН "Проблемы управления и моделирования в сложных системах, VII Международная конференция", 2005, Самара, с. 210-215.
  90. Любецкий В.А., Селиверстов А.В. Регуляция трансляции у Актинобактерий и Цианобактерий с участием вторичных структур мРНК, Труды конференции РАН "Проблемы управления и моделирования в сложных системах, VII Международная конференция", 2005, Самара, с. 216-221.
  91. Леонтьев Л.А., Селиверстов А.В., Любецкий В.А. Регуляция транскрипции с участием Т-боксов, Труды конференции РАН "Проблемы управления и моделирования в сложных системах, VII Международная конференция", 2005, Самара, с. 222-224.
  92. Любецкий В.А. Математические модели эволюции и регуляции экспрессии генов, Труды конференции РАН «Математические методы распознавания образов», 2005, Москва, с. 366-368.
  93. Леонтьев Л.А., Любецкий В.А. Массовый поиск консервативных регуляторных структур, содержащих Т-боксы: результаты счета. Информационные процессы, 2006 (в печати).
  94. Леонтьев Л.А., Любецкий В.А. Алгоритм определения белка, согласованного с заданным филогенетическим профилем. Информационные процессы, 2006 (в печати).
  95. Селиверстов А.В., Любецкий В.А. Алгоритм поиска консервативных участков в нуклеотидных последовательностях. Информационные процессы, 2006 (в печати).
  96. Любецкий В.А., Рубанов Л.И., Селиверстов А.В., Пирогов С.А. Модель регуляции экспрессии генов у бактерий на основе формирования вторичных структур РНК, Молекулярная биология, 2006, № 3 (в печати).
  97. Кановей В.Г., Любецкий В.А. Конфинальное семейство отношений эквивалентности, полных в своих борелевских классах. Труды Математического института РАН им. Стеклова, 2006, том 252 (в печати).
  98. Кановей В.Г., Любецкий В.А. Проблемы теоретико-множественного нестандартного анализа, Успехи математических наук, 2006 (в приготовлении).
  99. Кановей В.Г., Любецкий В.А., Реекен М. О сводимости монадических отношений эквивалентности, Математические заметки, 2006 (в приготовлении).
  100. Кановей В.Г., Любецкий В.А. Современная теория множеств: дескриптивная динамика. "Наука" (в приготовлении).
  101. Любецкий В.А., Пирогов С.А. Нестандартные представления локально компактных групп. Математические заметки, 2006 (в приготовлении).
  102. Голубцов П.В., Любецкий В.А. Моделирование результатов стохастических игр в зависимости от различных типов и объема доступной игрокам информации, Проблемы передачи информации (в приготовлении).

Вернуться